Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vsnl1P62761 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms