Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl18aP62717 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms