Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms