Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms