Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps13P62301 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps13P62301 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps13P62301 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps13P62301 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps13P62301 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps13P62301 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms