Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Usp46P62069 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp46P62069 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp46P62069 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp46P62069 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms