Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms