Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap25P60879 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap25P60879 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap25P60879 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms