Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppfia3P60469 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ppfia3P60469 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms