Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Eif3eP60229 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms