Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rin3P59729 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rin3P59729 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms