Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps5P59438 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms