Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ythdf1P59326 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ythdf1P59326 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms