Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P58686 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P58686 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P58686 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P58686 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P58686 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P58686 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P58686 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P58686 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P58686 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P58686 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P58686 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P58686 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P58686 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P58686 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P58686 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P58686 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P58686 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P58686 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P58686 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P58686 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P58686 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P58686 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P58686 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P58686 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P58686 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P58686 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P58686 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P58686 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P58686 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P58686 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P58686 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P58686 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P58686 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P58686 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P58686 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P58686 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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