Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp1P56716 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp1P56716 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp1P56716 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp1P56716 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp1P56716 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp1P56716 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rp1P56716 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rp1P56716 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms