Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd38P56528 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd38P56528 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd38P56528 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd38P56528 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd38P56528 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd38P56528 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd38P56528 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd38P56528 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd38P56528 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd38P56528 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd38P56528 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd38P56528 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd38P56528 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd38P56528 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd38P56528 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd38P56528 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd38P56528 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd38P56528 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd38P56528 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd38P56528 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd38P56528 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd38P56528 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd38P56528 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd38P56528 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms