Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp5eP56382 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms