Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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