Protein–RNA interactions for Protein: P54254

Atxn1, Ataxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn1P54254 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atxn1P54254 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms