Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RabggtbP53612 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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