Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms