Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Upp1P52624 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp1P52624 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp1P52624 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp1P52624 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp1P52624 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp1P52624 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp1P52624 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms