Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClgnP52194 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClgnP52194 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms