Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CntfP51642 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CntfP51642 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CntfP51642 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CntfP51642 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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