Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FanccP50652 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FanccP50652 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FanccP50652 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FanccP50652 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FanccP50652 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FanccP50652 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FanccP50652 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FanccP50652 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FanccP50652 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FanccP50652 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FanccP50652 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FanccP50652 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FanccP50652 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FanccP50652 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FanccP50652 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FanccP50652 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FanccP50652 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FanccP50652 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FanccP50652 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FanccP50652 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FanccP50652 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FanccP50652 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FanccP50652 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FanccP50652 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FanccP50652 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FanccP50652 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FanccP50652 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FanccP50652 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FanccP50652 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FanccP50652 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FanccP50652 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FanccP50652 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FanccP50652 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FanccP50652 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FanccP50652 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FanccP50652 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FanccP50652 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FanccP50652 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FanccP50652 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FanccP50652 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FanccP50652 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FanccP50652 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FanccP50652 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FanccP50652 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FanccP50652 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FanccP50652 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FanccP50652 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FanccP50652 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FanccP50652 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms