Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TubP50586 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TubP50586 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TubP50586 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TubP50586 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TubP50586 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TubP50586 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TubP50586 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TubP50586 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TubP50586 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TubP50586 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TubP50586 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TubP50586 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TubP50586 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TubP50586 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TubP50586 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TubP50586 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TubP50586 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TubP50586 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TubP50586 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TubP50586 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TubP50586 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TubP50586 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TubP50586 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TubP50586 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TubP50586 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TubP50586 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TubP50586 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TubP50586 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TubP50586 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TubP50586 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TubP50586 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TubP50586 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TubP50586 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TubP50586 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TubP50586 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TubP50586 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TubP50586 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TubP50586 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TubP50586 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TubP50586 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TubP50586 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TubP50586 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TubP50586 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TubP50586 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TubP50586 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TubP50586 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TubP50586 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TubP50586 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TubP50586 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TubP50586 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TubP50586 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TubP50586 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TubP50586 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TubP50586 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TubP50586 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TubP50586 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TubP50586 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TubP50586 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TubP50586 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TubP50586 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TubP50586 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TubP50586 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TubP50586 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TubP50586 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TubP50586 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TubP50586 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TubP50586 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TubP50586 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TubP50586 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TubP50586 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TubP50586 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TubP50586 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TubP50586 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TubP50586 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TubP50586 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TubP50586 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TubP50586 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TubP50586 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TubP50586 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TubP50586 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TubP50586 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TubP50586 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TubP50586 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TubP50586 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TubP50586 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TubP50586 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TubP50586 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TubP50586 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TubP50586 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TubP50586 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TubP50586 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TubP50586 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TubP50586 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TubP50586 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TubP50586 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TubP50586 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TubP50586 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TubP50586 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TubP50586 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms