Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt6aP50446 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms