Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpdP50404 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpdP50404 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SftpdP50404 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms