Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hcls1P49710 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcls1P49710 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcls1P49710 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcls1P49710 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcls1P49710 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcls1P49710 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcls1P49710 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcls1P49710 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcls1P49710 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcls1P49710 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcls1P49710 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcls1P49710 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcls1P49710 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcls1P49710 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcls1P49710 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcls1P49710 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcls1P49710 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcls1P49710 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcls1P49710 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcls1P49710 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcls1P49710 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms