Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtpreP49446 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtpreP49446 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtpreP49446 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtpreP49446 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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PtpreP49446 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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PtpreP49446 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpreP49446 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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PtpreP49446 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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PtpreP49446 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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PtpreP49446 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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