Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HpdP49429 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HpdP49429 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HpdP49429 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HpdP49429 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HpdP49429 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HpdP49429 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HpdP49429 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HpdP49429 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HpdP49429 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HpdP49429 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HpdP49429 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HpdP49429 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HpdP49429 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HpdP49429 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HpdP49429 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HpdP49429 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HpdP49429 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HpdP49429 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HpdP49429 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HpdP49429 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HpdP49429 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HpdP49429 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HpdP49429 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HpdP49429 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HpdP49429 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HpdP49429 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HpdP49429 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HpdP49429 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HpdP49429 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HpdP49429 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HpdP49429 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HpdP49429 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HpdP49429 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HpdP49429 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HpdP49429 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HpdP49429 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HpdP49429 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HpdP49429 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HpdP49429 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HpdP49429 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HpdP49429 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HpdP49429 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HpdP49429 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HpdP49429 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms