Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox8bP48772 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms