Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms