Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epb41P48193 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epb41P48193 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epb41P48193 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Epb41P48193 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Epb41P48193 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epb41P48193 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epb41P48193 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epb41P48193 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Epb41P48193 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epb41P48193 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epb41P48193 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epb41P48193 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epb41P48193 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epb41P48193 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epb41P48193 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Epb41P48193 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epb41P48193 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epb41P48193 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epb41P48193 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Epb41P48193 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epb41P48193 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epb41P48193 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epb41P48193 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epb41P48193 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epb41P48193 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epb41P48193 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epb41P48193 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epb41P48193 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Epb41P48193 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Epb41P48193 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Epb41P48193 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epb41P48193 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epb41P48193 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Epb41P48193 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Epb41P48193 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epb41P48193 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epb41P48193 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Epb41P48193 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epb41P48193 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epb41P48193 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epb41P48193 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epb41P48193 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epb41P48193 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Epb41P48193 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epb41P48193 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epb41P48193 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Epb41P48193 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epb41P48193 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epb41P48193 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epb41P48193 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epb41P48193 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epb41P48193 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb41P48193 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb41P48193 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Epb41P48193 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Epb41P48193 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Epb41P48193 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb41P48193 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Epb41P48193 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Epb41P48193 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb41P48193 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb41P48193 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Epb41P48193 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Epb41P48193 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb41P48193 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb41P48193 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms