Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gbx2P48031 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gbx2P48031 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gbx2P48031 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms