Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrprbP47758 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrprbP47758 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrprbP47758 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrprbP47758 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrprbP47758 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrprbP47758 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrprbP47758 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrprbP47758 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrprbP47758 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrprbP47758 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrprbP47758 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrprbP47758 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrprbP47758 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms