Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
InaP46660 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
InaP46660 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
InaP46660 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
InaP46660 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
InaP46660 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
InaP46660 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
InaP46660 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
InaP46660 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
InaP46660 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
InaP46660 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
InaP46660 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
InaP46660 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
InaP46660 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
InaP46660 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
InaP46660 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
InaP46660 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
InaP46660 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
InaP46660 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
InaP46660 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
InaP46660 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
InaP46660 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
InaP46660 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
InaP46660 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
InaP46660 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
InaP46660 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
InaP46660 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
InaP46660 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
InaP46660 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
InaP46660 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
InaP46660 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
InaP46660 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
InaP46660 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
InaP46660 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
InaP46660 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
InaP46660 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
InaP46660 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
InaP46660 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
InaP46660 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
InaP46660 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
InaP46660 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
InaP46660 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
InaP46660 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
InaP46660 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
InaP46660 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
InaP46660 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
InaP46660 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
InaP46660 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
InaP46660 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms