Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab11bP46638 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms