Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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