Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfamP40630 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfamP40630 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfamP40630 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfamP40630 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfamP40630 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfamP40630 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfamP40630 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfamP40630 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TfamP40630 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfamP40630 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfamP40630 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfamP40630 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfamP40630 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfamP40630 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfamP40630 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfamP40630 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfamP40630 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfamP40630 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfamP40630 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TfamP40630 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfamP40630 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfamP40630 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfamP40630 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfamP40630 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfamP40630 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfamP40630 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfamP40630 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfamP40630 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfamP40630 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfamP40630 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TfamP40630 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TfamP40630 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TfamP40630 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfamP40630 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfamP40630 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfamP40630 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfamP40630 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfamP40630 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfamP40630 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfamP40630 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfamP40630 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfamP40630 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms