Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtlP38585 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtlP38585 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtlP38585 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtlP38585 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TtlP38585 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtlP38585 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtlP38585 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtlP38585 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtlP38585 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtlP38585 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TtlP38585 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TtlP38585 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtlP38585 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtlP38585 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TtlP38585 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtlP38585 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtlP38585 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtlP38585 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtlP38585 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtlP38585 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtlP38585 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtlP38585 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TtlP38585 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TtlP38585 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TtlP38585 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TtlP38585 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TtlP38585 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TtlP38585 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TtlP38585 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TtlP38585 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TtlP38585 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TtlP38585 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TtlP38585 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TtlP38585 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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TtlP38585 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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TtlP38585 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TtlP38585 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TtlP38585 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TtlP38585 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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TtlP38585 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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TtlP38585 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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