Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HmgclP38060 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HmgclP38060 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HmgclP38060 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HmgclP38060 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HmgclP38060 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HmgclP38060 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HmgclP38060 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HmgclP38060 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HmgclP38060 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HmgclP38060 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HmgclP38060 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HmgclP38060 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HmgclP38060 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HmgclP38060 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HmgclP38060 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HmgclP38060 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms