Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprkP35822 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprkP35822 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprkP35822 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprkP35822 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprkP35822 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprkP35822 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprkP35822 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
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