Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn1P35821 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms