Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfc1P35601 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms