Protein–RNA interactions for Protein: P35492

Hal, Histidine ammonia-lyase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HalP35492 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HalP35492 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HalP35492 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HalP35492 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HalP35492 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HalP35492 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HalP35492 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HalP35492 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HalP35492 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HalP35492 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HalP35492 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HalP35492 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HalP35492 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HalP35492 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HalP35492 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HalP35492 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HalP35492 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms