Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab20P35295 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms