Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab23P35288 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms