Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp4P35123 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp4P35123 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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