Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdh15P33146 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms